Die wilde Fauna des Nationalparks von Nord Pindos ist reich, sowohl an der Gesamtzahl der Arten, als auch der Anwesenheit von seltenen und geschützten Arten. Fast alle großen Säugetiere des griechischen Festlandes, die selten sind,wie der Bär (Ursus arctos), der Wolf (Canis lupus), die Wildkatze (Felis sylvestris), der Fischotter (Lutra lutra), die Gämse (Rupicapra rupicapra balcanica) und das Reh (Capreolus capreolus), oder etwas öfter vorkommende, wie das Wildschwein (Sus scrofa), zeigen eine nennenswerte Population in der Region. Andere kleinere Säuge Tiere die man im Nationalpark findet, sind: der Fuchs (Vulpes vulpes), der Dachs (Meles meles), der Hase (Lepus capenis), der Igel (Erinaceus concolor), das Eichhörnchen (Sciurus vulgaris), der Marder (Martes foina), der Baummarder (Martes martes), viele kleine Säugetiere und mehrere Arten von Fledermäusen. Insgesamt sind im Nationalpark etwa 60 Arten von Säugetieren vorzufinden.
Von den180 Vogelartendes Gebietes, sind die Raubvögel von großem Interesse und vor allem der Schmutzgeier (Neophron percnopterus), der Steinadler (Aguila chrysaetos), der Wanderfalke (Falco pereginus), der Zwergadler (Hieraetus pennatus), der Schlangenadler (Circaetus gallicus) und der Lanner (Falco biarmicus). Ebenfalls bemerkenswert ist die Anwesenheit von Spechten, wie z.B der Schwarzspecht (Dryocopus martius) und der Blutspecht (Dendrocopos syriaca). Im Nationalpark trifft man auch andere wichtige Arten wie das Steinhuhn (Alectoris graeca), die Weidenmeise (Parus montanus), der Mauerläufer (Tichodroma muraria), die Wasseramsel (Cinclus cinclus), der Schwarzstorch (Ciconia nigra), die Ohrenlerche (Eremophilla alpestris), der Schneefink (Montifrigillani valis) u.a.
Zu den 30 Arten von Reptilien des Nationalparks gehören16 Eidechsenarten, 10 Schlangenarten und 4 Schildkrötenarten. Als Beispiel erwähnen wir das Auftreten der Pracht-Kieleidechse (Algyroides nigropunctatus), die Vierstreifennatter (Elaphequatrolineataa) und die Breitrandschildkröte (Testudo marginata).
Von den 14 Amphibienarten die man im Nationalpark antrifft, sind: der Feuersalamander (Salamandra salamandra), die Erdkröte (Bufo bufo), die Wechselkröte (Bufo viridis) und der Bergmolch (Triturus alpestris). Vor allem die Anwesenheit der letzteren ist leicht wahr zu nehmen da erin kleinen Kolonien in verchiedenen kleinen Seen und Teichen in den Hoch lagender Berge des Nationalparks wie z.B die Seen von Smolikas, Timfi und Flegga.
In Flüssen und Strömen des Nationalparks leben 17 Fischarten. Erwähnenswert ist die einheimische Art des Flusses Aoos, der Barbatus lapindus, die für Griechenland seltenen Albanischen Plötze (Pachychilon pictum), die im Komplex des Flusses Aoos und seiner Nebenflüsse auftreten, sowie die häufigen Spezies, wie die Forelle (Salmo trutta), der Döbel (Leuciscus cephalus), die Nase (Chondrostoma nasus) und der Barbus (Barbus peloponnesius).
